RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GLI2	P10070	1586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FSCN2	O14926	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FANCG	O15287	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GPR39	O43194	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CLEC3A	O75596	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ATF3	P18847	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	LIG1	P18858	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GABRE	P78334	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RING1	Q06587	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	STRN3	Q13033	797 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	PRODH	O43272	600 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	AKAP10	O43572	662 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	PPM1B	O75688	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	UBOX5	O94941	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ASL	P04424	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	MYL1	P05976	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CTSB	P07858	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	GBP1	P32455	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	FLT3	P36888	993 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	RAB27A	P51159	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	NEK4	P51957	841 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	MTMR1	Q13613	665 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	HID1	Q8IV36	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	BVES	Q8NE79	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	WHRN	Q9P202	907 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452		C9IYK1	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	CREB3	O43889	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	OPA1	O60313	960 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	AOC2	O75106	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	APP	P05067	770 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	IGFALS	P35858	605 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ID3	Q02535	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ITK	Q08881	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	STAT4	Q14765	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	LRRC41	Q15345	812 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	GRIK5	Q16478	980 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS2-215	ENST00000566452	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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