RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.1□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.1□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.1□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 EPHX1P07099 455 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 PDE6BP35913 854 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 JAG1P78504 1218 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 VHLLQ6RSH7 139 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 VPS37DQ86XT2 251 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 NAT16Q8N8M0 369 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 KCNK12Q9HB15 430 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GDE1-202ENST00000563645 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 A0A1W2PQY0 241 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 DBX1A6NMT0 343 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 CD3EP07766 207 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 POU4F1Q01851 419 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 PPP2R5DQ14738 602 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ZNF605Q86T29 641 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.08□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 TINF2Q9BSI4 451 aa6.08□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 NFIBO00712 420 aa6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 PEX10O60683 326 aa6.07□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 RAP1GAPP47736 663 aa6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ADGRF1Q5T601 910 aa6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.07□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.07□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 MED14OSP0DP75 135 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 GLDCP23378 1020 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ERVFRD-1P60508 538 aa6.06□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 TNNI3KQ59H18 835 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 HRKO00198 91 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 SEMA7AO75326 666 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 NAT2P11245 290 aa6.05□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 ARL4AP40617 200 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 GRB10Q13322 594 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 KIR3DS1Q14943 382 aa6.05□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.05□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.05□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 STXBP3O00186 592 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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GDE1-202ENST00000563645 ARID5AQ03989 594 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 FZD5Q13467 585 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 JAMLQ86YT9 394 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.04□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 BTBD11A6QL63 1104 aa6.03□□□□□ -1.44
GDE1-202ENST00000563645 E9PSI1 815 aa6.03□□□□□ -1.44
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