RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554070.1

AREL1-208, Transcript of apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene AREL1, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AREL1-208	ENST00000554070	FGD4	Q96M96	766 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	IGHD	P01880	384 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	NOV	P48745	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	SNAP25	P60880	206 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	ZNF536	O15090	1300 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
AREL1-208	ENST00000554070	PLA2G6	O60733	806 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TLE2	Q04725	743 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070		A0A1W2PQY0	241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ALAS1	P13196	640 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	HAND2	P61296	217 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070		Q7L0L9	218 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	BAD	Q92934	168 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ADCY6	O43306	1168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SDS	P20132	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ACLY	P53396	1101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	NUCB1	Q02818	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	KCNA10	Q16322	511 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	ITGB8	P26012	769 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SLC16A2	P36021	539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SHH	Q15465	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	SZT2	Q5T011	3432 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CLTB	P09497	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AREL1-208	ENST00000554070	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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