RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 MYH6P13533 1939 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CYTH3O43739 400 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 ERCC3P19447 782 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CDC27P30260 824 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 FCGRTP55899 365 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 EVCP57679 992 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 RTN1Q16799 776 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP2A1O14983 1001 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.099e-7■□□□□ 9
CTDSP2-207ENST00000551594 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM17Q9Y577 477 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 MAPK4P31152 587 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 OAZ1P54368 228 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 STK3Q13188 491 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 GPR142Q7Z601 462 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 PIGSQ96S52 555 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC25A27O95847 323 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ICAM1P05362 532 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ALAS1P13196 640 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 GNAQP50148 359 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 HOMER1Q86YM7 354 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 MTMR8Q96EF0 704 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 GABRQQ9UN88 632 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PLXNB2O15031 1838 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 RCAN1P53805 252 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 RABEP1Q15276 862 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 COA7Q96BR5 231 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 MROH8Q9H579 483 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PRKCZQ05513 592 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF6Q15052 776 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKRD1Q15327 319 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 USH1GQ495M9 461 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 SRRDQ9UH36 339 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 GJD2Q9UKL4 321 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 NID2Q14112 1375 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ZBTB5O15062 677 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PPFIA3O75145 1194 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 LARGE1O95461 756 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPREP23469 700 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 SMARCA1P28370 1054 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 FUT2Q10981 343 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF146Q9NTX7 359 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 HOXD10P28358 340 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 COPB2P35606 906 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 FLT3LGP49771 235 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 MORN1Q5T089 497 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 FBXO11Q86XK2 927 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 GNRH1P01148 92 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 ME3Q16798 604 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 NECAB1Q8N987 351 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 CHST13Q8NET6 341 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 MMP19Q99542 508 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-207ENST00000551594 PFKFB2O60825 505 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-207ENST00000551594 DTNBO60941 627 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-207ENST00000551594 FCER1AP12319 257 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-207ENST00000551594 SCRN1Q12765 414 aa21.76■■□□□ 1.07
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