RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RGL2O15211 777 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TPPPO94811 219 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TMCC1O94876 653 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 PODNQ7Z5L7 613 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC89Q8N998 374 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SLC26A4O43511 780 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 AP1G2O75843 785 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CIAO1O76071 339 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TUBA4AP68366 448 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MUM1Q2TAK8 710 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 SPATA32Q96LK8 384 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MTRQ99707 1265 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SNRKQ9NRH2 765 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 CEP78Q5JTW2 689 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 H0YCG3 227 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 STX6O43752 255 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM87BQ96K49 555 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CEP63Q96MT8 703 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO40Q9UH90 709 aa6.94□□□□□ -1.3
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