RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	NEDD4	P46934	1319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PPC1	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ICAM1	P05362	532 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	FGD4	Q96M96	766 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	KRT23	Q9C075	422 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	KDM4A	O75164	1064 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137		B4E1Z4	1266 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SGSM2	O43147	1006 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	AKR1A1	P14550	325 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	BMP8B	P34820	402 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	LRRC41	Q15345	812 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	GDF15	Q99988	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	MAF1	Q9H063	256 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RARB	P10826	455 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ALAS1	P13196	640 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	NKX3-2	P78367	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SNX17	Q15036	470 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ASB14	A6NK59	587 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CYP21A2	P08686	494 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SLC16A2	P36021	539 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RNF180	Q86T96	592 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	TNKS	O95271	1327 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PTH1R	Q03431	593 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SEC23A	Q15436	765 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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