RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CHRNDQ07001 517 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 ITPK1Q13572 414 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 A0A0G2JS52 829 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 CYP2C19P33261 490 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 TTC6Q86TZ1 520 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 CNGA4Q8IV77 575 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-214ENST00000540109 SLF2Q8IX21 1173 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 BTAF1O14981 1849 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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