RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		8.71	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		8.71	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM221	A6NGB7	291 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	GYPC	P04921	128 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CCNG1	P51959	295 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	MYBPC2	Q14324	1141 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	RAPGEF5	Q92565	580 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	RUBCN	Q92622	972 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC51	Q96ER9	411 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	IWS1	Q96ST2	819 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	GFPT2	O94808	682 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	TMCC1	O94876	653 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	IDE	P14735	1019 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP11A	P98196	1134 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	PPARA	Q07869	468 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	WHAMM	Q8TF30	809 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CORO1B	Q9BR76	489 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	GMEB1	Q9Y692	573 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		8.7	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CA8	P35219	290 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	GUCY2F	P51841	1108 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	USP46	P62068	366 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SMYD1	Q8NB12	490 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCF2	Q9UG63	623 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SBNO1	A3KN83	1393 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SMAP	O00193	183 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CTDNEP1	O95476	244 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM153B	P0C7A2	387 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	GSTT1	P30711	240 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM153C	Q494X1	144 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	CD302	Q8IX05	232 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NEK1	Q96PY6	1258 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	MTA3	Q9BTC8	594 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NACA2	Q9H009	215 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NFU1	Q9UMS0	254 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	HIP1R	O75146	1068 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	VCAM1	P19320	739 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF827	Q17R98	1081 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	IFT81	Q8WYA0	676 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	VCX3B	Q9H321	246 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351		F8VZ95	297 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351		F8W031	263 aa	Predicted RBP	8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	NDUFA10	O95299	355 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	MYZAP	P0CAP1	466 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP6V1C1	P21283	382 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	DRD4	P21917	467 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	TMED1	Q13445	227 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	C8orf74	Q6P047	294 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	PI16	Q6UXB8	463 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SLF2	Q8IX21	1173 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	LINS1	Q8NG48	757 aa		8.68	□□□□□ -1.02
ZNF438-208	ENST00000538351	FBF1	Q8TES7	1133 aa		8.68	□□□□□ -1.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms