RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PFKFB2O60825 505 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC175P0C221 793 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MYBL2P10244 700 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CDC27P30260 824 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 BTDP43251 543 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CRKP46108 304 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GNGT1P63211 74 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PRKG1Q13976 671 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 IQCA1Q86XH1 822 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ERICH2A1L162 156 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MBD4O95243 580 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CHGBP05060 677 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GNAT2P19087 354 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PRDX5P30044 214 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PDE4BQ07343 736 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GBP3Q9H0R5 595 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 KIF5CO60282 957 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 FGFR2P21802 821 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PNOCQ13519 176 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 STIM1Q13586 685 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CABP5Q9NP86 173 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 EPHX2P34913 555 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 APPBP2Q92624 585 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MXD3Q9BW11 206 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SHTN1A0MZ66 631 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CTAGE9A4FU28 777 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GLTPD2A6NH11 291 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RTN2O75298 545 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PFKFB1P16118 471 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PDE6AP16499 860 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CEP57Q86XR8 500 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.31□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 WDR93Q6P2C0 686 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 COG1Q8WTW3 980 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PDHBP11177 359 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 STK38Q15208 465 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 KLC4Q9NSK0 619 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQ27 194 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQ64 194 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQD8 194 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 KIF3CO14782 793 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 FSBPO95073 299 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 IL1R1P14778 569 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MECOMQ03112 1051 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ARMT1Q9H993 441 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 BMP6P22004 513 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 NEK1Q96PY6 1258 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 WLSQ5T9L3 541 aa11.29□□□□□ -0.6
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