RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 DLK2Q6UY11 383 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 HOMER1Q86YM7 354 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SPICE1Q8N0Z3 855 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC148Q8NFR7 591 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CHURC1Q8WUH1 139 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 LPAR1Q92633 364 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CHAMP1Q96JM3 812 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BARHL2Q9NY43 387 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CFAP45Q9UL16 551 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 FZD1Q9UP38 647 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SCN4AP35499 1836 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SSC5DA1L4H1 1573 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BTBD18B2RXH4 712 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 STXBP3O00186 592 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZBTB5O15062 677 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PLA2G6O60733 806 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 KRT2P35908 639 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 USP14P54578 494 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SPP2Q13103 211 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 WWC2Q6AWC2 1192 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 GALNT17Q6IS24 598 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF280CQ8ND82 737 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 MTMR8Q96EF0 704 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CNPY2Q9Y2B0 182 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CSADQ9Y600 493 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 KIF28PB7ZC32 967 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 C19orf81C9J6K1 198 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 STAT2P52630 851 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NAPAP54920 295 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 FAM160B2Q86V87 743 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SHISA4Q96DD7 197 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 FEM1BQ9UK73 627 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 GNA11P29992 359 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BACE1P56817 501 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TRAF1Q13077 416 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 MTMR2Q13614 643 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 VGLL4Q14135 290 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 MAP3K11Q16584 847 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 LDHDQ86WU2 507 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 OXER1Q8TDS5 423 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 C6orf50Q9HD87 102 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ESYT2A0FGR8 921 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SMCO2A6NFE2 343 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM75PA6NK02 468 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 FIBPO43427 364 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NR5A1Q13285 461 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NPY5RQ15761 445 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BLIDQ8IZY5 108 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BICD2Q8TD16 824 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 COA7Q96BR5 231 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SPATA32Q96LK8 384 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 MYH4Q9Y623 1939 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ELP1O95163 1332 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 UNCXA6NJT0 531 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms