RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHOXO15266 292 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMNB1P20700 586 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXO4P98177 505 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP2B2Q01814 1243 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM160A1Q05DH4 1040 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAPTM5Q13571 262 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REC114Q7Z4M0 266 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPRED1Q7Z699 444 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOX5Q96PH1 765 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP40Q9NVE5 1235 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GFOD1Q9NXC2 390 aa2.24□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TLR3O15455 904 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASGR2P07307 311 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6P13671 934 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VAV1P15498 845 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BMP8BP34820 402 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACVRL1P37023 503 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPZQ66K79 652 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OLFML2BQ68BL8 750 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OVOS1Q6IE37 1185 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFPM1Q8IX07 1006 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM192Q8IY95 271 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CARFQ8N187 725 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM161BQ96MY7 647 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MENTQ9BUN1 341 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDADC1Q9BWV3 514 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANTXR1Q9H6X2 564 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RXFP1Q9HBX9 757 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHST7Q9NS84 486 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa2.23□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PQY0 241 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRGAP3O43295 1099 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TACR2P21452 398 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGM1P22735 817 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TACR1P25103 407 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMLP29590 882 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GBP1P32455 592 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL4AP40617 200 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRKP46108 304 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF4P78317 190 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR5P85299 388 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRIP3Q6Q6R5 217 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRMD6Q96NE9 622 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC12A9Q9BXP2 914 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRRDQ9UH36 339 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP31Q70CQ4 1352 aa2.22□□□□□ -2.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9IYK1 514 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPNT1O95861 308 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYBBP04839 570 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAG1P15918 1043 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFKLP17858 780 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST13P50502 369 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGA2P52926 109 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR1I3Q14994 352 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRB2Q5IJ48 1285 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDCP2Q5VXM1 449 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAQR3Q6TCH7 311 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLM1Q8NBJ4 401 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATG4CQ96DT6 458 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOXL4Q96JB6 756 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM74Q96NL1 305 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRIQ9BWK5 157 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNNM2Q9H8M5 875 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRMS1Q9HCU9 246 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COPRSQ9NQ92 184 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMIPQ9P107 970 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PALD1Q9ULE6 856 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa2.21□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H0Y8X5 98 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATE1O95260 518 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLATP00750 562 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLI4P10075 376 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACRP10323 421 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GJA9P57773 515 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DAB2P98082 770 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM62Q0P6H9 643 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLF10Q13118 480 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPP2Q14168 576 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ICAM4Q14773 271 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BICRALQ6AI39 1079 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXL19Q6PCT2 694 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.7 ms