RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514905.5

ZBED3-AS1-215, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3-AS1, Length 1,156 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CDK8P49336 464 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 BEX3Q00994 111 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 RAB30Q15771 203 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 HERVK_113Q902F9 699 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 BCL11AQ9H165 835 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 EPHX3Q9H6B9 360 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 IL23AQ9NPF7 189 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SWAP70Q9UH65 585 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 ELP1O95163 1332 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GOLIM4O00461 696 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CTAGE5O15320 804 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CD4P01730 458 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 FGBP02675 491 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CCL23P55773 120 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 ACVR2BQ13705 512 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SCN5AQ14524 2016 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GNASQ5JWF2 1037 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CCDC174Q6PII3 467 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 DDX11Q96FC9 970 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 FGD4Q96M96 766 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SH2D4AQ9H788 454 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 RAB11FIP3O75154 756 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GJA9P57773 515 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 KRT40Q6A162 431 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CPXCR1Q8N123 301 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CERS4Q9HA82 394 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 MYH4Q9Y623 1939 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 ASTN1O14525 1302 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 MYH7P12883 1935 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 USP17L12C9JPN9 530 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 USP17L21D6R901 530 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 MBD4O95243 580 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 C12orf60Q5U649 245 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 VWCEQ96DN2 955 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CCDC17Q96LX7 622 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CRBNQ96SW2 442 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 HIPK3Q9H422 1215 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SPC25Q9HBM1 224 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GRIN2DO15399 1336 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 EPOPA6NHQ4 379 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 ZBBXA8MT70 800 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 COPB2P35606 906 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 ARMCX2Q7L311 632 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 SCLYQ96I15 445 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 KATNBL1Q9H079 304 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 GOPCQ9HD26 462 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 PSMC6P62333 389 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 CNTN2Q02246 1040 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-215ENST00000514905 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms