RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.55■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.55■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 RAD21O60216 631 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 RPS6KB1P23443 525 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 LIFRP42702 1097 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 RLFQ13129 1914 aa23.54■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 CCDC69A6NI79 296 aa23.53■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.53■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 PARP14Q460N5 1801 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 F5H6K3 240 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 NMT2O60551 498 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 KLRC3Q07444 240 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 GRB14Q14449 540 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 ANKRD1Q15327 319 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 CHST3Q7LGC8 479 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 MB21D1Q8N884 522 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.52■■□□□ 1.36
USP53-208ENST00000514305 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 FLOT1O75955 427 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 FBXL16Q8N461 479 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 PNMA1Q8ND90 353 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.51■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 STRNO43815 780 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 HOXC6P09630 235 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 CALM1P0DP23 149 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 CALM2P0DP24 149 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 CALM3P0DP25 149 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ANTXR2P58335 489 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 PLS1Q14651 629 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SEC23AQ15436 765 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SLFN13Q68D06 897 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 DPP9Q86TI2 863 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 DCAF4Q8WV16 495 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.5■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SLC1A4P43007 532 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 RABEP1Q15276 862 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 GMCL1Q96IK5 515 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 PRO3102Q9H379 93 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.49■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 A0A1W2PPC1 479 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 LHX8Q68G74 356 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 Q6ZUG5 572 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 DCBLD2Q96PD2 775 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 LY9Q9HBG7 655 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 MSCO60682 206 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 BMP3P12645 472 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ERCC3P19447 782 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ADORA2AP29274 412 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 CNGA1P29973 690 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 NEK4P51957 841 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ATG4CQ96DT6 458 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 MAP3K14Q99558 947 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 MROH8Q9H579 483 aa23.47■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ST18O60284 1047 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 DDAH1O94760 285 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 NDUFB10O96000 172 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 KIF5BP33176 963 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 PPP2R5BQ15173 497 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
USP53-208ENST00000514305 PFASO15067 1338 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CYP2C19P33261 490 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 RCAN1P53805 252 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CCDC96Q2M329 555 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 FAM160B2Q86V87 743 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms