RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IL23AQ9NPF7 189 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDH23Q9H251 3354 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FGBP02675 491 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RASA1P20936 1047 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGFBP4P22692 258 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF365Q70YC5 407 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARMCX2Q7L311 632 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PANK1Q8TE04 598 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HERVK_113Q902F9 699 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIFC2Q96AC6 838 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HIPK3Q9H422 1215 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIPK3Q9Y572 518 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYADML2A6NDP7 307 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ASB14A6NK59 587 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ACRP10323 421 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GNAT2P19087 354 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PBX2P40425 430 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NKX3-2P78367 333 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNFAIP2Q03169 654 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AAK1Q2M2I8 961 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTC28Q96AY4 2481 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPATCH3Q96I76 525 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ACAD9Q9H845 621 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMIM22K7EJ46 135 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL1O95922 423 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CD4P01730 458 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CYP2C18P33260 490 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TDO2P48775 406 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STAT2P52630 851 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TKFCQ3LXA3 575 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM160B2Q86V87 743 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COG6Q9Y2V7 657 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYH7P12883 1935 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PFKMP08237 780 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BMP3P12645 472 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDE4BQ07343 736 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ITGA7Q13683 1181 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TLK2Q86UE8 772 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 APPBP2Q92624 585 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MKL1Q969V6 931 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADCY6O43306 1168 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 APPP05067 770 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSPY3P0CV98 308 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSPY8P0CW00 308 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BEX3Q00994 111 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLFN13Q68D06 897 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CEP95Q96GE4 821 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FGD4Q96M96 766 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF146Q9NTX7 359 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms