RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 RNF4P78317 190 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MAP4K2Q12851 820 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRE1Q14246 886 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 BRD3Q15059 726 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SV2CQ496J9 727 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM240Q5SV17 173 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO11Q86XK2 927 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ACSBG1Q96GR2 724 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TTC1Q99614 292 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MAF1Q9H063 256 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 IFT22Q9H7X7 185 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM39Q9HCM9 518 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SYNJ1O43426 1573 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ABLIM3O94929 683 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SCGB1D2O95969 90 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 GRB10Q13322 594 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MBTPS1Q14703 1052 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 KRT72Q14CN4 511 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 POU4F3Q15319 338 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DUOXA2Q1HG44 320 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NSMFQ6X4W1 530 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB46Q86UZ6 589 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DGKHQ86XP1 1220 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 STK11IPQ8N1F8 1099 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEB6Q8N7X4 407 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL23Q8NBE8 558 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 OR2W6PQ8NHA6 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TTC8Q8TAM2 541 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF507Q8TCN5 953 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PPM1EQ8WY54 764 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PTPRN2Q92932 1015 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PLPPR2Q96GM1 343 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC74BQ96LY2 380 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CLUHP3Q96NS8 147 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ANTXR1Q9H6X2 564 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 FAM105AQ9NUU6 356 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SUSD2Q9UGT4 822 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MROH2BQ7Z745 1585 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SHTN1A0MZ66 631 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ANO9A1A5B4 782 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PPM1BO75688 479 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 RAPGEF3O95398 923 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CPP00450 1065 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 HTR3AP46098 478 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 OCRLQ01968 901 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PDE3AQ14432 1141 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PPM1JQ5JR12 505 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 FAM209AQ5JX71 171 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SYDE2Q5VT97 1194 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 FOXB2Q5VYV0 432 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 OSBP2Q969R2 916 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MRGPRX3Q96LB0 322 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL25Q9H0H3 589 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 WHRNQ9P202 907 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 USP21Q9UK80 565 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NOP56O00567 594 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ERC2O15083 957 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ULK1O75385 1050 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SCG5P05408 212 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM27P14373 513 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 HOXC12P31275 282 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 EVA1CP58658 441 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PPP2R2AP63151 447 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 STAT4Q14765 748 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TESK1Q15569 626 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NKG7Q16617 165 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CNNM4Q6P4Q7 775 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF227Q86WZ6 799 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 HID1Q8IV36 788 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 BVESQ8NE79 360 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 USP7Q93009 1102 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 FBRSQ9HAH7 460 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF69Q9UC07 566 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 EMC9Q9Y3B6 208 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PBRM1Q86U86 1689 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 F8W735 103 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 AQP7O14520 342 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms