RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 SLIT3O75094 1523 aa9.53□□□□□ -0.88
VWA3B-220ENST00000495571 USP31Q70CQ4 1352 aa9.52□□□□□ -0.88
VWA3B-220ENST00000495571 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.52□□□□□ -0.88
VWA3B-220ENST00000495571 TTC26A0AVF1 554 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ERICH2A1L162 156 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PRPHP41219 470 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KLK7P49862 253 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 BLMHQ13867 455 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KRT31Q15323 416 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 RAPGEF5Q92565 580 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 GPATCH3Q96I76 525 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SENP2Q9HC62 589 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PIK3C2AO00443 1686 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 B4DLN1 442 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SMAPO00193 183 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CYP27B1O15528 508 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 TRAPPC3O43617 180 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM24O75264 130 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KIAA1328Q86T90 577 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 IL17REQ8NFR9 667 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SUCLG2Q96I99 432 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SYT15Q9BQS2 421 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.52□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF263O14978 683 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 EVI5O60447 810 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PDHA1P08559 390 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 MCM3P25205 808 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PLCD1P51178 756 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CUL4BQ13620 913 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CFAP58Q5T655 872 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 RNF220Q5VTB9 566 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 BATF3Q9NR55 127 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 H7C1W4 665 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 AHCYL1O43865 530 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 EPHB4P54760 987 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ALS2CLQ60I27 953 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CNGA4Q8IV77 575 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 TSC22D3Q99576 134 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PLAAQ9Y263 795 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 C2CD2Q9Y426 696 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 HIP1O00291 1037 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 N4BP3O15049 544 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 GUCY2DQ02846 1103 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PROSER3Q2NL68 480 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 ZFATQ9P243 1243 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 STIM2Q9P246 746 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 PPFIA2O75334 1257 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 MOCS3O95396 460 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3B-220ENST00000495571 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms