RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 NELFBQ8WX92 580 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 DISC1Q9NRI5 854 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TMEM260Q9NX78 707 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 AKR1B1P15121 316 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PRCPP42785 496 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PDE4CQ08493 712 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 VPS16Q9H269 839 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TXLNAP40222 546 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PBX1P40424 430 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 UBA7P41226 1012 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KRT31Q15323 416 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KRT222Q8N1A0 295 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 A0A0U1RQJ8 604 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 STX10O60499 249 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CCDC93Q567U6 631 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 COA7Q96BR5 231 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TXNRD1Q16881 649 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SP8Q8IXZ3 490 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 WDR24Q96S15 920 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PAK1Q13153 545 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 GALNT17Q6IS24 598 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SLF2Q8IX21 1173 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CASP14P31944 242 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 NT5C2P49902 561 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.098e-8■□□□□ 9
PRAME-213ENST00000492657 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 EPC1Q9H2F5 836 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 N4BP3O15049 544 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CCP110O43303 1012 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZSCAN12O43309 604 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KLRC4O43908 158 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PDHBP11177 359 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CERS3Q8IU89 383 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TBCKQ8TEA7 893 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 C6orf50Q9HD87 102 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 USP40Q9NVE5 1235 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.092e-28■□□□□ 9.6
PRAME-213ENST00000492657 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PLCG1P19174 1290 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 TECP42680 631 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 GNG11P61952 73 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SOGA3Q5TF21 947 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 MYH8P13535 1937 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 GYPCP04921 128 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 OR52Z1P0C646 297 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 GABPAQ06546 454 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CABP7Q86V35 215 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 COA1Q9GZY4 146 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 KCNJ18B7U540 433 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SRGNP10124 158 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CAPN2P17655 700 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms