RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF536O15090 1300 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 PFKFB2O60825 505 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 SLC4A3P48751 1232 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 PPP2R5BQ15173 497 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 HOMER1Q86YM7 354 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD10-202ENST00000490088 FKTNO75072 461 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 STAT3P40763 770 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 SCRN1Q12765 414 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PIGSQ96S52 555 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PORCNQ9H237 461 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ATP2A1O14983 1001 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 SMARCA1P28370 1054 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 OAZ1P54368 228 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CCNA1P78396 465 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 FUT2Q10981 343 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 NECAB1Q8N987 351 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 IL27Q8NEV9 243 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 MTMR8Q96EF0 704 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ICAM1P05362 532 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 EFCC1Q9HA90 598 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 RIPK3Q9Y572 518 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ZBTB5O15062 677 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PPFIA3O75145 1194 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CTGFP29279 349 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 LBX1P52954 281 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 NTRK3Q16288 839 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CPLX1O14810 134 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ERCC3P19447 782 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 CAP1Q01518 475 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 USH1GQ495M9 461 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 WDR78Q5VTH9 848 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 GTF3C6Q969F1 213 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 SLC25A27O95847 323 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ALAS1P13196 640 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PSMC4P43686 418 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 KIF22Q14807 665 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 FBXO11Q86XK2 927 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 PHKBQ93100 1093 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXD10-202ENST00000490088 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 DTNBO60941 627 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 IFNAR1P17181 557 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 MAPK4P31152 587 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 MCM2P49736 904 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 ST3GAL1Q11201 340 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 ERO1AQ96HE7 468 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 TRIM47Q96LD4 638 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 FCGRTP55899 365 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC83Q8IWF9 413 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 TRERF1Q96PN7 1200 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 AMNQ9BXJ7 453 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 MROH8Q9H579 483 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 RNF146Q9NTX7 359 aa25■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 COPB2P35606 906 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 TKFCQ3LXA3 575 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 GPR142Q7Z601 462 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 TMX3Q96JJ7 454 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 PNMA2Q9UL42 364 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 CTDNEP1O95476 244 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 CHST13Q8NET6 341 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 COA7Q96BR5 231 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 ABCB11O95342 1321 aa24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms