RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 FANCLQ9NW38 375 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 TBX1O43435 398 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CLSTN1O94985 981 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 FGFR1P11362 822 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 NBPF11Q86T75 865 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 ASB11Q8WXH4 323 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CCDC140Q96MF4 163 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 CDC6Q99741 560 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 DUSP13Q9UII6 198 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL20-204ENST00000489160 WASH4PA8MWX3 477 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 HOXC12P31275 282 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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CCL20-204ENST00000489160 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.27□□□□□ -1.25
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CCL20-204ENST00000489160 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 PRODHO43272 600 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 VAMP4O75379 141 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 CD3EP07766 207 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 VAV1P15498 845 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 LTKP29376 864 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 GRIA2P42262 883 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 AOC3Q16853 763 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 NSMFQ6X4W1 530 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 IER2Q9BTL4 223 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 TCFL5Q9UL49 500 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ZNF205O95201 554 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 CPP00450 1065 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SCG5P05408 212 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SYPP08247 313 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 GFRA1P56159 465 aa7.25□□□□□ -1.25
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CCL20-204ENST00000489160 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 CREG2Q8IUH2 290 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 FLCNQ8NFG4 579 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 EXOC2Q96KP1 924 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.25□□□□□ -1.25
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CCL20-204ENST00000489160 AURKAO14965 403 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS4O75173 837 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 L1CAMP32004 1257 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 KCNJ6P48051 423 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 MAP4K2Q12851 820 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 BNIP3Q12983 259 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 TCEA2Q15560 299 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 FAM209AQ5JX71 171 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 OSBP2Q969R2 916 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.23□□□□□ -1.25
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CCL20-204ENST00000489160 ESR1P03372 595 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 EGR3Q06889 387 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SCRN1Q12765 414 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SPRED2Q7Z698 418 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 COPS5Q92905 334 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 FEZ1Q99689 392 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ASMTLO95671 621 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 GSTM1P09488 218 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 CD8BP10966 210 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 IFNGR1P15260 489 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ECI1P42126 302 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SEPHS1P49903 392 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 IKZF1Q13422 519 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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