RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SHC4Q6S5L8 630 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TIGD1Q96MW7 591 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 HPSEQ9Y251 543 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SMCO2A6NFE2 343 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 M0R2N6 131 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF202O95125 648 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SYKP43405 635 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 JAG1P78504 1218 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 UVSSAQ2YD98 709 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 DLK2Q6UY11 383 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 KCTD1Q719H9 257 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FERMT2Q96AC1 680 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GMCL1Q96IK5 515 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CLIC6Q96NY7 704 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SDF4Q9BRK5 362 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GGA3Q9NZ52 723 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.85□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ADM5C9JUS6 153 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 F5H6K3 240 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS3O15072 1205 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 RAD21O60216 631 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFB10O96000 172 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ADCY7P51828 1080 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 KLRC3Q07444 240 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF174Q15697 407 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR8Q96EF0 704 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L10C9JJH3 530 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 WNT7AO00755 349 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB5O15062 677 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CAVIN2O95810 425 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM7P33993 719 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC16A2P36021 539 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K10Q02779 954 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 RASA3Q14644 834 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 STX1AQ16623 288 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.83□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 BMP3P12645 472 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CAP2P40123 477 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 GRIN1Q05586 938 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 PTGDRQ13258 359 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 INF2Q27J81 1249 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 COA7Q96BR5 231 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CSRNP2Q9H175 543 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 SH2D4AQ9H788 454 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 GOPCQ9HD26 462 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 TMX2Q9Y320 296 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.82□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PRG0 241 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXN1O15353 648 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 SPECC1Q5M775 1068 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.81□□□□□ -0.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
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