RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 COPB2P35606 906 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 SLC16A2P36021 539 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 C1QTNF8P60827 252 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 PIGSQ96S52 555 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 AMNQ9BXJ7 453 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.06■□□□□ 0
NISCH-208ENST00000481211 JAK2O60674 1132 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ICAM1P05362 532 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 HERVK_113P62684 666 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 TKFCQ3LXA3 575 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 FBXO11Q86XK2 927 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 IFNL1Q8IU54 200 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 RLFQ13129 1914 aa15.05■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 TRIM29Q14134 588 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 PKN1Q16512 942 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 GALNT17Q6IS24 598 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 HOMER1Q86YM7 354 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ATG4CQ96DT6 458 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 DDX11Q96FC9 970 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 PTPN18Q99952 460 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ALG1Q9BT22 464 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 CPVLQ9H3G5 476 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 BARHL2Q9NY43 387 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 MYH6P13533 1939 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ABCB11O95342 1321 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ESYT2A0FGR8 921 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 CALML3P27482 149 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 REPS2Q8NFH8 660 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 GNA11P29992 359 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 CCNA1P78396 465 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 MCTP2Q6DN12 878 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 BICD2Q8TD16 824 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 C8orf76Q96K31 380 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NISCH-208ENST00000481211 ZNF536O15090 1300 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 STXBP3O00186 592 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 SLC25A27O95847 323 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 VEGFBP49765 207 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 FBXO40Q9UH90 709 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 H3BQV1 296 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 CA12O43570 354 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 STAT3P40763 770 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 NAPAP54920 295 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 GRM1Q13255 1194 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 FAM110CQ1W6H9 321 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 IFFO2Q5TF58 517 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 CCDC174Q6PII3 467 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 DAGLBQ8NCG7 672 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 CHST13Q8NET6 341 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 PIBF1Q8WXW3 757 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 C6orf50Q9HD87 102 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-208ENST00000481211 TLR2O60603 784 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms