RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	DLL1	O00548	723 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ERC2	O15083	957 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	OIP5	O43482	229 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ULK1	O75385	1050 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ADAMTS2	O95450	1211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ADH5	P11766	374 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	DGKG	P49619	791 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	IL2	P60568	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF4	P78317	190 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	FBXO11	Q86XK2	927 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	OSBP2	Q969R2	916 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ISL2	Q96A47	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	AKT3	Q9Y243	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	NRDC	O43847	1150 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CP	P00450	1065 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CFB	P00751	764 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	TRIM27	P14373	513 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PHKG2	P15735	406 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GRIA2	P42262	883 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	KCNJ6	P48051	423 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	FOXQ1	Q9C009	403 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CABP5	Q9NP86	173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.04	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996		A0A087WZG4	1122 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	NEMP1	O14524	444 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GABRD	O14764	452 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	LRIG2	O94898	1065 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ABLIM3	O94929	683 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	F2	P00734	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	BPI	P17213	487 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CD247	P20963	164 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	AMPD1	P23109	780 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	HOXC12	P31275	282 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP2C19	P33261	490 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	MAP4K2	Q12851	820 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GTF2H3	Q13889	308 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	DYM	Q7RTS9	669 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	LGR4	Q9BXB1	951 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	OBP2A	Q9NY56	170 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KDM4C-208	ENST00000480996	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SHOX	O15266	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TBX1	O43435	398 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	WISP1	O95388	367 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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