RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf159Q96HA4 380 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXQ1Q9C009 403 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ASXL2Q76L83 1435 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 VSTM5A8MXK1 200 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PPFIA4O75335 1185 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CPP00450 1065 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SCG5P05408 212 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 NAT1P18440 290 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PAX3P23760 479 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.161e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-209ENST00000473406 STYK1Q6J9G0 422 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO41Q8TF61 875 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ISL2Q96A47 359 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 MBIPQ9NS73 344 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 OBP2AQ9NY56 170 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 K7ESF4 209 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R082 166 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CBX4O00257 560 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FKBP9O95302 570 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 F2P00734 622 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ECI1P42126 302 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 GUCY1A3Q02108 690 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 TICAM2Q86XR7 235 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 NXPE1Q8N323 547 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FIBCD1Q8N539 461 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF4Q8WV16 495 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PIDD1Q9HB75 910 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3BP5O60239 455 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GAS7O60861 476 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 LRIG2O94898 1065 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 MYBL2P10244 700 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 EPXP11678 715 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ADH5P11766 374 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNA6P17658 529 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DGKGP49619 791 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DSG1Q02413 1049 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 TPH2Q8IWU9 490 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 VWCEQ96DN2 955 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM27P14373 513 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CCND1P24385 295 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 AMPD2Q01433 879 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ASPNQ9BXN1 380 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GFRA3O60609 400 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ULK1O75385 1050 aa7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms