RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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CCDC78-204ENST00000439619 TTC14Q96N46 770 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC78-204ENST00000439619 RNF146Q9NTX7 359 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC78-204ENST00000439619 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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CCDC78-204ENST00000439619 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC78-204ENST00000439619 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC78-204ENST00000439619 SPC25Q9HBM1 224 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC78-204ENST00000439619 MYH4Q9Y623 1939 aa22.14■■□□□ 1.14
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CCDC78-204ENST00000439619 TDHQ8IZJ6 230 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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CCDC78-204ENST00000439619 ACVR2BQ13705 512 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 IQCA1Q86XH1 822 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 FERMT2Q96AC1 680 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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CCDC78-204ENST00000439619 PHF24Q9UPV7 400 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC78-204ENST00000439619 ICAM1P05362 532 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF536O15090 1300 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 ARMCX2Q7L311 632 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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CCDC78-204ENST00000439619 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.1■■□□□ 1.13
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CCDC78-204ENST00000439619 PDHBP11177 359 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 CNTN2Q02246 1040 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 KRT23Q9C075 422 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC78-204ENST00000439619 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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CCDC78-204ENST00000439619 ZNF543Q08ER8 600 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 KAT14Q9H8E8 782 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 NEDD4P46934 1319 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 KDM4AO75164 1064 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 TTC22Q5TAA0 569 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 GPR153Q6NV75 609 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 FGD4Q96M96 766 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC78-204ENST00000439619 TLE2Q04725 743 aa22.05■■□□□ 1.12
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