RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429205.6

SENP3-202, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SENP3, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-202ENST00000429205 MMP1P03956 469 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PEX19P40855 299 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CACNB3P54284 484 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 GABPAQ06546 454 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SHISA4Q96DD7 197 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.2■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 UTRNP46939 3433 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 BTBD18B2RXH4 712 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CORO7P57737 925 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 DACT1Q9NYF0 836 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 AP5Z1O43299 807 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ME1P48163 572 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 RASA3Q14644 834 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NR1I2O75469 434 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 RPS6KA3P51812 740 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 MTFR1LQ9H019 292 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ZNF232Q9UNY5 417 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 MTMR7Q9Y216 660 aa15.18■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 YEATS4O95619 227 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 MYBL2P10244 700 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 KIF5BP33176 963 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 STK38Q15208 465 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 E2F4Q16254 413 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ANO1Q5XXA6 986 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ZNF280DQ6N043 979 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CEP95Q96GE4 821 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SLURP2P0DP57 97 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 TCP10Q12799 353 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CAMK4Q16566 473 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 OXER1Q8TDS5 423 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 EXOC4Q96A65 974 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PIM2Q9P1W9 311 aa15.17■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SPTLC2O15270 562 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 RAD17O75943 681 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 TGFB2P61812 414 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NR5A1Q13285 461 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 GRM4Q14833 912 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CXorf38Q8TB03 319 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 MAP3K14Q99558 947 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 COL4A5P29400 1685 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 AKR1B1P15121 316 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 HLA-DOAP06340 250 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 XBP1P17861 261 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SHMT1P34896 483 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NEDD9Q14511 834 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 CFAP100Q494V2 611 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 IDI2Q9BXS1 227 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 PSMD14O00487 310 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 NOVP48745 357 aa15.15■□□□□ 0.02
SENP3-202ENST00000429205 SLC39A14Q15043 492 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms