RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 STAT6P42226 847 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 GYS2P54840 703 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 CRY2Q49AN0 593 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 MXD3Q9BW11 206 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CHP1Q99653 195 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 RMND1Q9NWS8 449 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 F8W031 263 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP25P42331 645 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 BLIDQ8IZY5 108 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 RGL2O15211 777 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM6Q14566 821 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PLIN2Q99541 437 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PP2D1A8MPX8 630 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 RCSD1Q6JBY9 416 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf32Q8N8J7 132 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BQF6 201 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM14Q14142 442 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 GGA1Q9UJY5 639 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR7Q9Y216 660 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PLSCR1O15162 318 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF5BP33176 963 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 KAT14Q9H8E8 782 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 DISC1Q9NRI5 854 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2K7O14733 419 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L8P0C7I0 530 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CALML3P27482 149 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 DOK7Q18PE1 504 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC26A0AVF1 554 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CTAGE8P0CG41 777 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNA5P30532 468 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBB2AQ13885 445 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCB6Q9NP58 842 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEB2H3BUK9 544 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB21Q9UL25 225 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 H7C1D1 291 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TFAP4Q01664 338 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ADSSL1Q8N142 457 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CD209Q9NNX6 404 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFA10O95299 355 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 VSNL1P62760 191 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 MB21D1Q8N884 522 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA1Q8ND90 353 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 TFR2Q9UP52 801 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ERLIN1O75477 346 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 USP5P45974 858 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 GPS2Q13227 327 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms