RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 RLFQ13129 1914 aa12.88□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa12.88□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CYBAP13498 195 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 SLC16A2P36021 539 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TSGA10IPQ3SY00 556 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 SKAP1Q86WV1 359 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 ANKRD35Q8N283 1001 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TINF2Q9BSI4 451 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 MTMR7Q9Y216 660 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 WDR19Q8NEZ3 1342 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 SLC27A2O14975 620 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 SEPT4O43236 478 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 PGK2P07205 417 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 SLC4A3P48751 1232 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 STOX1Q6ZVD7 989 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 RGS22Q8NE09 1264 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TMEM87BQ96K49 555 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 RNF146Q9NTX7 359 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 PFASO15067 1338 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 A0A0G2JMZ2 1700 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 POTEB2H3BUK9 544 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 ALAS1P13196 640 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 MCM5P33992 734 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 RASGRP2Q7LDG7 609 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 NECAB2Q7Z6G3 386 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 FAM133AQ8N9E0 248 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 MAP3K14Q99558 947 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CCPG1Q9ULG6 757 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 MGAMO43451 1857 aa12.85□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 MYH8P13535 1937 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 GOLGA8HP0CJ92 632 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CNGA1P29973 690 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 LIFRP42702 1097 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TROAPQ12815 778 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TRAF1Q13077 416 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 WTAPQ15007 396 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CCDC174Q6PII3 467 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 ADGRF4Q8IZF3 695 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 ARRDC4Q8NCT1 418 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 TRPV1Q8NER1 839 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 UBA5Q9GZZ9 404 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CYP39A1Q9NYL5 469 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CNPY2Q9Y2B0 182 aa12.84□□□□□ -0.35
PDCL-202ENST00000394285 CENPFP49454 3210 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 ASB14A6NK59 587 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 KLRF2D3W0D1 207 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 REC8O95072 547 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 SMARCA1P28370 1054 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 ANTXR2P58335 489 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 SNAP25P60880 206 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 KRT32Q14532 448 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 MUM1L1Q5H9M0 696 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 TMEM67Q5HYA8 995 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 KCNB2Q92953 911 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 MTMR8Q96EF0 704 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 HOMER2Q9NSB8 354 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 PRC1O43663 620 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 COL6A1P12109 1028 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 GRM4Q14833 912 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 SAMD3Q8N6K7 520 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 FGD4Q96M96 766 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 NEK1Q96PY6 1258 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 JMJD4Q9H9V9 463 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL-202ENST00000394285 PLXNB2O15031 1838 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms