RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	FUT2	Q10981	343 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	C17orf99	Q6UX52	265 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CPA4	Q9UI42	421 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB5	O15062	677 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CNMD	O75829	334 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	TBC1D8	O95759	1140 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	BCR	P11274	1271 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ERVK-24	P63145	666 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	NTRK3	Q16288	839 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	HOMER1	Q86YM7	354 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	HSCB	Q8IWL3	235 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ICAM1	P05362	532 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CCNA1	P78396	465 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	TRAF1	Q13077	416 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC174	Q6PII3	467 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	PIGS	Q96S52	555 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	COPB2	P35606	906 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SNAP25	P60880	206 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	PLS1	Q14651	629 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CPXCR1	Q8N123	301 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	STAT3	P40763	770 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF536	O15090	1300 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC25A27	O95847	323 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	ST3GAL1	Q11201	340 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	PHKB	Q93100	1093 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	AMN	Q9BXJ7	453 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GKAP1-204	ENST00000388782	STK36	Q9NRP7	1315 aa		28.64	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	MYH6	P13533	1939 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	PEX10	O60683	326 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	CTDNEP1	O95476	244 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782		Q3C1V9	767 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	ABCB11	O95342	1321 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	GPR25	O00155	361 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	DEXI	O95424	95 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	SP3	Q02447	781 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	MROH8	Q9H579	483 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	ALAS1	P13196	640 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	SCG2	P13521	617 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	MAPK4	P31152	587 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	CUL4A	Q13619	759 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	USH1G	Q495M9	461 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GKAP1-204	ENST00000388782	ERCC3	P19447	782 aa		28.58	■■■□□ 2.17

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