RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC4A3P48751 1232 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GJA9P57773 515 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACVR2BQ13705 512 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCTN1Q2MV58 587 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMCX2Q7L311 632 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 MB21D1Q8N884 522 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELP1O95163 1332 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLXNA3P51805 1871 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERC2O15083 957 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAD21O60216 631 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 MBD4O95243 580 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP2C9P11712 490 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDK8P49336 464 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCTD2Q14681 263 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB30Q15771 203 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNASQ5JWF2 1037 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CPXCR1Q8N123 301 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHOX2BQ99453 314 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIPK3Q9H422 1215 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 MSRAQ9UJ68 235 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.56□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GOLIM4O00461 696 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A27O95847 323 aa6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 FGBP02675 491 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMPD1P17405 629 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNAP25P60880 206 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP8B2P98198 1209 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAP1Q03518 808 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRB10Q13322 594 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 C12orf60Q5U649 245 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 AACSQ86V21 672 aa6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM199Q8N511 208 aa6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL11AQ9H165 835 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBBXA8MT70 800 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L12C9JPN9 530 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L21D6R901 530 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL9P15248 144 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKX3-2P78367 333 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGA7Q13683 1181 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPNMBQ14956 572 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP85Q6P2H3 762 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTR9Q6PD62 1173 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL27Q8NEV9 243 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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