RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CDKL5O76039 1030 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CYP21A2P08686 494 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 SYKP43405 635 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 LMAN1P49257 510 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP4BP1P59074 171 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 SH3BP2P78314 561 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 MAP9Q49MG5 647 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 HAUS7Q99871 368 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 DEF6Q9H4E7 631 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 RAB21Q9UL25 225 aa8.15□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GVL5 298 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 A6NNZ2 444 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 GPTP24298 496 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 RFC4P35249 363 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 FOXO4P98177 505 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TXNRD1Q16881 649 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 KANK3Q6NY19 840 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 MTRQ99707 1265 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 NYXQ9GZU5 481 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PRU2 124 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PDE8AO60658 829 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 APBA3O96018 575 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 C4AP0C0L4 1744 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 APOBRQ0VD83 1088 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ANO1Q5XXA6 986 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ATCAYQ86WG3 371 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 MLKLQ8NB16 471 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC51Q96ER9 411 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PANX2Q96RD6 677 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 S1PR4O95977 384 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CSF1RP07333 972 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PFKFB1P16118 471 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 SCNN1DP51172 638 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ST5P78524 1137 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A14Q15043 492 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 FAM26DQ5JW98 314 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 FAM89AQ96GI7 184 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 GPR108Q9NPR9 543 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PARP2Q9UGN5 583 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CDC23Q9UJX2 597 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF609O15014 1411 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CPLX1O14810 134 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB39O15060 712 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CIAO1O76071 339 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 FAM13AO94988 1023 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 CTDNEP1O95476 244 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 KCNQ4P56696 695 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TNNI3KQ59H18 835 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 RPAINQ86UA6 219 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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