RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF536O15090 1300 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PRC1O43663 620 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ADORA2AP29274 412 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 GNAQP50148 359 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ANTXR2P58335 489 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 DPP9Q86TI2 863 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 USP26Q9BXU7 913 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ACAD9Q9H845 621 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 LY9Q9HBG7 655 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RPTORQ8N122 1335 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 GJB1P08034 283 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ANAPC15P60006 121 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 GRM4Q14833 912 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 IL27Q8NEV9 243 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MTMR8Q96EF0 704 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 IL17RAQ96F46 866 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MMP19Q99542 508 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MSCO60682 206 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 INHAP05111 366 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 WDR78Q5VTH9 848 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RASEFQ8IZ41 740 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC69A6NI79 296 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 KLRF2D3W0D1 207 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PEX10O60683 326 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP2B6P20813 491 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CPXCR1Q8N123 301 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIB2Q92519 343 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RIPK3Q9Y572 518 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CCL5P13501 91 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ELNP15502 786 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 GJA8P48165 433 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 GHRHRQ02643 423 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 DDX11Q96FC9 970 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MAML3Q96JK9 1138 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF146Q9NTX7 359 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCB11O95342 1321 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 ZBTB5O15062 677 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 COBLO75128 1261 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC16A2P36021 539 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 SOX10P56693 466 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 EVCP57679 992 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 TINF2Q9BSI4 451 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF208Q9H0X6 261 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.19□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 B4DLN1 442 aa14.19□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 SGPL1O95470 568 aa14.19□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 ALAS1P13196 640 aa14.19□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
KCNQ1-203ENST00000345015 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms