RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD1Q15327 319 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 NBPF11Q86T75 865 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 RCAN1P53805 252 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 OAZ1P54368 228 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 EVCP57679 992 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM47Q96LD4 638 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF536O15090 1300 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ATP2A1O14983 1001 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC3P19447 782 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK4P31152 587 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF6Q15052 776 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 RABEP1Q15276 862 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CYTH3O43739 400 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A27O95847 323 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 HOMER1Q86YM7 354 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 RIPK3Q9Y572 518 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 CDC27P30260 824 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 STK3Q13188 491 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM17Q9Y577 477 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 ICAM1P05362 532 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R5BQ15173 497 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 GPR142Q7Z601 462 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 COA7Q96BR5 231 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 PIGSQ96S52 555 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 MROH8Q9H579 483 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 ALAS1P13196 640 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 COPB2P35606 906 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 NID2Q14112 1375 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCA1P28370 1054 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 USH1GQ495M9 461 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB5O15062 677 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 GNRH1P01148 92 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR8Q96EF0 704 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 HOXD10P28358 340 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO11Q86XK2 927 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 RNF146Q9NTX7 359 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA2Q9UL42 364 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD4-201ENST00000306324 ST18O60284 1047 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 TKFCQ3LXA3 575 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 FCER1AP12319 257 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 PTPREP23469 700 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 PRKCZQ05513 592 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 CHST13Q8NET6 341 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 AMNQ9BXJ7 453 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 ACAD9Q9H845 621 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 SRRDQ9UH36 339 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO40Q9UH90 709 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 GABRQQ9UN88 632 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 CENPFP49454 3210 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 HTTP42858 3142 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 STRNO43815 780 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 LARGE1O95461 756 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 ME3Q16798 604 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 MMP19Q99542 508 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms