RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 A0A1B0GTH6 734 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 ADAMTS3O15072 1205 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 TEX33O43247 280 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 SCP2P22307 547 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 USP5P45974 858 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 MTF1Q14872 753 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 GRIK5Q16478 980 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA1Q92805 767 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 STX10O60499 249 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 PTGDRQ13258 359 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 C12orf60Q5U649 245 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 CCDC102AQ96A19 550 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 PNKPQ96T60 521 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 ZSCAN12O43309 604 aa22.64■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 SCG2P13521 617 aa22.64■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.64■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ERLIN2O94905 339 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PPP2R5AQ15172 486 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 SPATA1Q5VX52 437 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 GSDMAQ96QA5 445 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PPFIA4O75335 1185 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 GSTO1P78417 241 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 TFAP4Q01664 338 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 HDXQ7Z353 690 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 KAT14Q9H8E8 782 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ABCB6Q9NP58 842 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 BRD3Q15059 726 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 KIF5BP33176 963 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 GPSM2P81274 684 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ADRA2BP18089 450 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 TRAPPC10P48553 1259 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 BAG3O95817 575 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 NLRP5P59047 1200 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 IL17AQ16552 155 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 RNF217Q8TC41 542 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 SGSM3Q96HU1 749 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 L1RE1Q9UN81 338 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 A0A0U1RQJ8 604 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 KIFC2Q96AC6 838 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 CDC25AP30304 524 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PBX1P40424 430 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 RPAINQ86UA6 219 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 DGKHQ86XP1 1220 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PNMA1Q8ND90 353 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 UFL1O94874 794 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 NT5C2P49902 561 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PPP4CP60510 307 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 MCM7P33993 719 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 CRY2Q49AN0 593 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 CERKQ8TCT0 537 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 GYS1P13807 737 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 MTRQ99707 1265 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 AFF2P51816 1311 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS6-201ENST00000299238 USP17L3A6NCW0 530 aa22.58■■□□□ 1.2
HPS6-201ENST00000299238 USP17L4A6NCW7 530 aa22.58■■□□□ 1.2
HPS6-201ENST00000299238 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HPS6-201ENST00000299238 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.58■■□□□ 1.2
HPS6-201ENST00000299238 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.58■■□□□ 1.2
HPS6-201ENST00000299238 EP400Q96L91 3159 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS6-201ENST00000299238 LDHCP07864 332 aa22.57■■□□□ 1.2
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