RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 OTUD5Q96G74 571 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SMCO2A6NFE2 343 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 CHADLQ6NUI6 762 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO11Q86XK2 927 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PARP14Q460N5 1801 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 FLOT1O75955 427 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SNAP25P60880 206 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAF1Q13077 416 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 BICD2Q8TD16 824 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFRSF25Q93038 417 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 USP28Q96RU2 1077 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA32Q96LK8 384 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCY7P51828 1080 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 PPIL2Q13356 520 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-201ENST00000298838 IRF6O14896 467 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 OPTNQ96CV9 577 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 ELP1O95163 1332 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R2N6 131 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCL11O14625 94 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USH1GQ495M9 461 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CUL5Q93034 780 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS3O15072 1205 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC174Q6PII3 467 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 FDX1P10109 184 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 ANO1Q5XXA6 986 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 RLFQ13129 1914 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM205CA6NFA0 338 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L15C9J2P7 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L11C9JVI0 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L18D6R9N7 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L22D6RA61 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L19D6RCP7 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L20D6RJB6 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L24Q0WX57 530 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CLIC4Q9Y696 253 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 YEATS4O95619 227 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 ICAM1P05362 532 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC10P48553 1259 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 COG2Q14746 738 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 STK38Q15208 465 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA2Q9UL42 364 aa23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3-201ENST00000298838 VWA5AO00534 786 aa23.7■■□□□ 1.38
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