RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 TEKT1Q969V4 418 aa27.08■■□□□ 1.93
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TRIM54-201ENST00000296098 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIM54-201ENST00000296098 OR52Z1P0C646 297 aa27.07■■□□□ 1.92
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TRIM54-201ENST00000296098 NEK8Q86SG6 692 aa27.07■■□□□ 1.92
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TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD7Q92527 254 aa27.04■■□□□ 1.92
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TRIM54-201ENST00000296098 STX10O60499 249 aa27.03■■□□□ 1.92
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
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TRIM54-201ENST00000296098 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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TRIM54-201ENST00000296098 IGSF22Q8N9C0 903 aa27■■□□□ 1.91
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TRIM54-201ENST00000296098 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27■■□□□ 1.91
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TRIM54-201ENST00000296098 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TRIM54-201ENST00000296098 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
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TRIM54-201ENST00000296098 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.97■■□□□ 1.91
TRIM54-201ENST00000296098 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.97■■□□□ 1.91
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