RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 STXBP3O00186 592 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 NRDCO43847 1150 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELF2Q15723 593 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 E2F4Q16254 413 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 MORC3Q14149 939 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNED1Q8TER0 1413 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFIAQ12857 509 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM196BA6NMK8 535 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 COBLO75128 1261 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 HLA-DOAP06340 250 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL17AQ16552 155 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 C6orf50Q9HD87 102 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 PP2D1A8MPX8 630 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM232C9JQI7 657 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP27XA6NNY8 438 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 STAT6P42226 847 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC96Q2M329 555 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBA7P41226 1012 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYH1P12882 1939 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CRKP46108 304 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCZ1BP86790 482 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 COA7Q96BR5 231 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 GNA11P29992 359 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDHBP11177 359 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 GALNT17Q6IS24 598 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 PODNQ7Z5L7 613 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXO41Q8TF61 875 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM212AQ96EL1 285 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFCC1Q9HA90 598 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 UTRNP46939 3433 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC16A2P36021 539 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 CUL4BQ13620 913 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ECE2O60344 883 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTLL1O95922 423 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 DPYDQ12882 1025 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPN14Q15678 1187 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSDMAQ96QA5 445 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM260Q9NX78 707 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 AOC3Q16853 763 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD1Q719H9 257 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYO1CO00159 1063 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYP2C19P33261 490 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 GABPAQ06546 454 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms