RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 WDR59Q6PJI9 974 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX1-201ENST00000261889 KRT23Q9C075 422 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 MOCS3O95396 460 aa14.57□□□□□ -0.08
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SNX1-201ENST00000261889 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 XBP1P17861 261 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 STK4Q13043 487 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 SEC23AQ15436 765 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX1-201ENST00000261889 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.53□□□□□ -0.08
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