RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 ZMYM6O95789 1325 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 TECP42680 631 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SUSD4Q5VX71 490 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 URGCPQ8TCY9 931 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1B0GVL5 298 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 OR52Z1P0C646 297 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 PANK4Q9NVE7 773 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ABCC3O15438 1527 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 MYL5Q02045 173 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 RLBP1P12271 317 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF365Q70YC5 407 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC25Q86WR0 208 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SGSM2O43147 1006 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP2R5DQ14738 602 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 POSTNQ15063 836 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 RDH13Q8NBN7 331 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 MMP19Q99542 508 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ATG3Q9NT62 314 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ZBTB16Q05516 673 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 FANCBQ8NB91 859 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF233A6NK53 670 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 KBTBD13C9JR72 458 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 PODNQ7Z5L7 613 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 C7orf31Q8N865 590 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 DPYSL4O14531 572 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 TRIM7Q9C029 511 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SMC5Q8IY18 1101 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SMC6Q96SB8 1091 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SREBF2Q12772 1141 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 LRMPQ12912 555 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.97□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 CPA1P15085 419 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 TYRO3Q06418 890 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 NCAPD2Q15021 1401 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 GANCQ8TET4 914 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 FEM1BQ9UK73 627 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 TUBB4AP04350 444 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 NELFBQ8WX92 580 aa14.96□□□□□ -0.01
PDGFRB-201ENST00000261799 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.96□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 DENND3A2RUS2 1198 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SASH1O94885 1247 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 ADORA1P30542 326 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC12A2P55011 1212 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 TTC30AQ86WT1 665 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 ATP5DP30049 168 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 OPA1O60313 960 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 DCAF4Q8WV16 495 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 OTUD5Q96G74 571 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 PDE6CP51160 858 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 HAUS1Q96CS2 278 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 IQCDQ96DY2 449 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 VPS16Q9H269 839 aa14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms