RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 ATL3Q6DD88 541 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 TNS4Q8IZW8 715 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SPATA32Q96LK8 384 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.817e-14■■■□□ 15.6
SRSF1-201ENST00000258962 GNAQP50148 359 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 USP14P54578 494 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SP3Q02447 781 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CFAP45Q9UL16 551 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PNMA3Q9UL41 463 aa20.11■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CYTH3O43739 400 aa20.1■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.1■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PDHBP11177 359 aa20.1■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.1■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SNHG28P0DPA3 235 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CYP2C8P10632 490 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 OSBPP22059 807 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 TREML2Q5T2D2 321 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 ACER1Q8TDN7 264 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 ERO1AQ96HE7 468 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.09■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 KLRF2D3W0D1 207 aa20.08■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SCG2P13521 617 aa20.08■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.08■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.08■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 BTBD18B2RXH4 712 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ATP2B2Q01814 1243 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ICA1Q05084 483 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 DGKZQ13574 1117 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGEF6Q15052 776 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 PGBD1Q96JS3 809 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 CPVLQ9H3G5 476 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 SH2D4AQ9H788 454 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 CPA4Q9UI42 421 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRFP10586 1907 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 XBP1P17861 261 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 KIF22Q14807 665 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 NPY5RQ15761 445 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 C17orf99Q6UX52 265 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 OXER1Q8TDS5 423 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 NYAP2Q9P242 653 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 CLIC4Q9Y696 253 aa20.07■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 MKL1Q969V6 931 aa20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 SMARCA1P28370 1054 aa20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF543Q08ER8 600 aa20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 NR5A1Q13285 461 aa20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 C12orf42Q96LP6 360 aa20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1W2PRG0 241 aa20.04■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.04■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L15C9J2P7 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L11C9JVI0 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L18D6R9N7 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L22D6RA61 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L19D6RCP7 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L20D6RJB6 530 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 YEATS4O95619 227 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 KRT2P35908 639 aa20.03■□□□□ 0.8
SRSF1-201ENST00000258962 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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