RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 KLRF2D3W0D1 207 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXD11-201ENST00000249504 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 CNMDO75829 334 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 FDX1P10109 184 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A3P48751 1232 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 CCNA1P78396 465 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 NTRK3Q16288 839 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXD11-201ENST00000249504 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 CPLX1O14810 134 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 SMARCA1P28370 1054 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD11-201ENST00000249504 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CTDNEP1O95476 244 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 IFNAR1P17181 557 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 FUT2Q10981 343 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXD11-201ENST00000249504 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 Q3C1V9 767 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXD11-201ENST00000249504 CPVLQ9H3G5 476 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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HOXD11-201ENST00000249504 FCGRTP55899 365 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CPXCR1Q8N123 301 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 REPS2Q8NFH8 660 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CYTH3O43739 400 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CDKL5O76039 1030 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 WDR78Q5VTH9 848 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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HOXD11-201ENST00000249504 STAT3P40763 770 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SNAP25P60880 206 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC174Q6PII3 467 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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HOXD11-201ENST00000249504 PORCNQ9H237 461 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 MAPK4P31152 587 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 OAZ1P54368 228 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 EFCC1Q9HA90 598 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 ATP2A1O14983 1001 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A27O95847 323 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 COPB2P35606 906 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 PHKBQ93100 1093 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM17Q9Y577 477 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 STK36Q9NRP7 1315 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 JAK2O60674 1132 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CTGFP29279 349 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 COA7Q96BR5 231 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM47Q96LD4 638 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD11-201ENST00000249504 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 DTNBO60941 627 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 PPFIA3O75145 1194 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 ERCC3P19447 782 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 HOXD10P28358 340 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 MTMR8Q96EF0 704 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 MROH8Q9H579 483 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.52■■□□□ 1.19
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