RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 PTPREP23469 700 aa22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 NR1I3Q14994 352 aa22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 MTF1Q14872 753 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 KANK3Q6NY19 840 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 KAT14Q9H8E8 782 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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VGF-201ENST00000249330 A0A1B0GTH6 734 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 BTBD18B2RXH4 712 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 DDAH1O94760 285 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 DEXIO95424 95 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 EXOC4Q96A65 974 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.77■■□□□ 1.24
VGF-201ENST00000249330 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.76■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 DGKHQ86XP1 1220 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 MYH1P12882 1939 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 POTEB2H3BUK9 544 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 KIF5CO60282 957 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CALM1P0DP23 149 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CALM2P0DP24 149 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CALM3P0DP25 149 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 PPP2R5BQ15173 497 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 PKN1Q16512 942 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CEP112Q8N8E3 955 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 PNMA1Q8ND90 353 aa22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN26Q16670 478 aa22.75■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.75■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 TCP10Q12799 353 aa22.75■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.75■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.75■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.74■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.74■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CDC23Q9UJX2 597 aa22.74■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.74■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.74■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 H3BQF6 201 aa22.73■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 RAD17O75943 681 aa22.73■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 TUBB2AQ13885 445 aa22.73■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.73■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CCDC125Q86Z20 511 aa22.73■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.73■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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VGF-201ENST00000249330 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 OXER1Q8TDS5 423 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 ANKS1AQ92625 1134 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 CEP95Q96GE4 821 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 TEX33O43247 280 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 ERLIN1O75477 346 aa22.72■■□□□ 1.23
VGF-201ENST00000249330 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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