RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMB1P07942 1786 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 IVLP07476 585 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TTI2Q6NXR4 508 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMA7O14818 248 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MMS19Q96T76 1030 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V1AP38606 617 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 RETREG2Q8NC44 543 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC102AQ96A19 550 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP58Q9BVL2 599 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ENC1O14682 589 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MECOMQ03112 1051 aa24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM47Q96LD4 638 aa24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT86O43790 486 aa24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPY2A6NKD2 308 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP9Q49MG5 647 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2D6P10635 497 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5C2P49902 561 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKS1AQ92625 1134 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOC1Q9NV70 894 aa24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 RASSF10A6NK89 507 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 LAD1O00515 517 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 SRLQ86TD4 932 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKHQ86XP1 1220 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ANO9A1A5B4 782 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PP2D1A8MPX8 630 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 UBA7P41226 1012 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT17Q6IS24 598 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CUEDC2Q9H467 287 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 KAT14Q9H8E8 782 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 B4DLN1 442 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO1CO00159 1063 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PRPHP41219 470 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ITPK1Q13572 414 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1328Q86T90 577 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 SIK1P57059 783 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBED6P86452 979 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK17Q00537 523 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 TFR2Q9UP52 801 aa24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 SRGAP2O75044 1071 aa24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 GRM4Q14833 912 aa24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ERFEQ4G0M1 354 aa24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 RCCD1A6NED2 376 aa24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNE1P24864 410 aa24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 FIGNQ5HY92 759 aa24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC15Q8TF66 581 aa24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.56
HTATSF1-201ENST00000218364 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 GNAQP50148 359 aa24.76■■□□□ 1.55
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