RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF1AQ12756 1690 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 A1BGP04217 495 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 DNM2P50570 870 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SEC24CP53992 1094 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBED6P86452 979 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 C8orf74Q6P047 294 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CENPHQ9H3R5 247 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 THAP9Q9H5L6 903 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF14Q9UBS8 474 aa20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 B4E1Z4 1266 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SRGNP10124 158 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 GHRP10912 638 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC7A5Q01650 507 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP2B2Q01814 1243 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ICA1Q05084 483 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SH2D4AQ9H788 454 aa20.52■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC24Q50LG9 513 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 FIGNQ5HY92 759 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP57Q86XR8 500 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 WHAMMQ8TF30 809 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.51■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A1W2PQJ5 194 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 E7EVH7 732 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 DNM1LO00429 736 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PPARAQ07869 468 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ALX1Q15699 326 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 IQCDQ96DY2 449 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CABP5Q9NP86 173 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 FBXO3Q9UK99 471 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 MYH6P13533 1939 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 KLHL33A6NCF5 533 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 GMNCA6NCL1 334 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PAFAH1B1P43034 410 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 MYL10Q9BUA6 226 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.5■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAPPC3O43617 180 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 LCA5LO95447 670 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PAEPP09466 180 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SEMA3FQ13275 785 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 OXER1Q8TDS5 423 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 MTA3Q9BTC8 594 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ADD2P35612 726 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 RTN1Q16799 776 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.49■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 RASSF10A6NK89 507 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 COBLO75128 1261 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SCTRP47872 440 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC181Q5TID7 509 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ADSSL1Q8N142 457 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 EBF2Q9HAK2 575 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 TSKSQ9UJT2 592 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.48■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF263O14978 683 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ZAP70P43403 619 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 SPA17Q15506 151 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 HINFPQ9BQA5 517 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.47■□□□□ 0.87
CGRRF1-201ENST00000216420 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms