RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 EVA1CP58658 441 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 PTGDRQ13258 359 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1328Q86T90 577 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 BTG4Q9NY30 223 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 IL17AQ16552 155 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 LCORLQ8N3X6 602 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 GNGT1P63211 74 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 NPY5RQ15761 445 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 SAMM50Q9Y512 469 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 SNAP23O00161 211 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 EBAG9O00559 213 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTS2O95450 1211 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 TDO2P48775 406 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 PPFIA1Q13136 1202 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ERICH2A1L162 156 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 LGALS16A8MUM7 142 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 KLK7P49862 253 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 TTC38Q5R3I4 469 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 GPATCH11Q8N954 259 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 IDEP14735 1019 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 TNFRSF25Q93038 417 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 JADE2Q9NQC1 790 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTS3O15072 1205 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 CYP27A1Q02318 531 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 FUT2Q10981 343 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 FAM107BQ9H098 131 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-222ENST00000639501 RASSF10A6NK89 507 aa22.95■■□□□ 1.26
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PMS1-222ENST00000639501 PDE8BO95263 885 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MEA1Q16626 185 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ARL8AQ96BM9 186 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 POLD4Q9HCU8 107 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 GPTP24298 496 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SLC7A5Q01650 507 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 TTMPQ5BVD1 217 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SH3GL2Q99962 352 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 TNKSO95271 1327 aa22.94■■□□□ 1.26
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PMS1-222ENST00000639501 CREG2Q8IUH2 290 aa22.94■■□□□ 1.26
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PMS1-222ENST00000639501 B4DLN1 442 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 SPATA5Q8NB90 893 aa22.93■■□□□ 1.26
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PMS1-222ENST00000639501 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 DOCK2Q92608 1830 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 KRT83P78385 493 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 CEP89Q96ST8 783 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 EHD2Q9NZN4 543 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ZNF263O14978 683 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PQC6 194 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-222ENST00000639501 ANO9A1A5B4 782 aa22.92■■□□□ 1.26
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