RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637570.1

DCX-211, Transcript of doublecortin, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene DCX, Length 6,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCX-211ENST00000637570 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 DRC3Q9H069 523 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 DPH5Q9H2P9 285 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 ERBB3P21860 1342 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 WDR62O43379 1518 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 AKR1B10O60218 316 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 GANCQ8TET4 914 aa6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 GIPC1O14908 333 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 ARHGEF9O43307 516 aa6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 ELF2Q15723 593 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 MIER2Q8N344 545 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 DHX58Q96C10 678 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RUNDC1Q96C34 613 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TINF2Q9BSI4 451 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TOR3AQ9H497 397 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 PANK3Q9H999 370 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TMEM165Q9HC07 324 aa6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 SNAP25P60880 206 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 TBC1D5Q92609 795 aa6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 SKIP12755 728 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 KRT85P78386 507 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 PSME1Q06323 249 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TCEA2Q15560 299 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 PARP8Q8N3A8 854 aa6.8□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 VPS39Q96JC1 886 aa6.8□□□□□ -1.32
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DCX-211ENST00000637570 STX12Q86Y82 276 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 EVI5LQ96CN4 794 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 CCT7Q99832 543 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 APOL6Q9BWW8 343 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RMI1Q9H9A7 625 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 N4BP3O15049 544 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 GMFGO60234 142 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 LGR5O75473 907 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 VAV1P15498 845 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 MAGEA9P43362 315 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TCP11Q8WWU5 503 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 JADE3Q92613 823 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 POLKQ9UBT6 870 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 POTEB2H3BUK9 544 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 GOLGA8RI6L899 631 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 NDUFB5O43674 189 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 CCDC22O60826 627 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 SERPIND1P05546 499 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 MSH2P43246 934 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 KRT72Q14CN4 511 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 USP33Q8TEY7 942 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 TOP1MTQ969P6 601 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.79□□□□□ -1.32
DCX-211ENST00000637570 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.79□□□□□ -1.32
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