RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	BLID	Q8IZY5	108 aa		16.02	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	16.02	■□□□□ 0.15	7e-7	■□□□□ 8.2
NEDD4L-238	ENST00000635997		M0QZ92	97 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDC25A	P30304	524 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CYP4A11	Q02928	519 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATL3	Q6DD88	541 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CPVL	Q9H3G5	476 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997		H0YHG0	523 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	NR1I2	O75469	434 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SRGN	P10124	158 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CYP2D6	P10635	497 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC17	Q96LX7	622 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	DISP2	A7MBM2	1401 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SCG2	P13521	617 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPP2	Q13103	211 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PNOC	Q13519	176 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP2R5B	Q15173	497 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TBC1D5	Q92609	795 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TNS2	Q63HR2	1409 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TIGD1	Q96MW7	591 aa		16.01	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	NR5A1	Q13285	461 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CHADL	Q6NUI6	762 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	NEK11	Q8NG66	645 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CABP7	Q86V35	215 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRPA1	O75762	1119 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	HS1BP3	Q53T59	392 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	USP37	Q86T82	979 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		16	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	BICDL2	A1A5D9	508 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TERF1	P54274	439 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CBX8	Q9HC52	389 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15	2e-6	■■■■■ 27.9
NEDD4L-238	ENST00000635997	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CXCL9	Q07325	125 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	GLG1	Q92896	1179 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	AZI2	Q9H6S1	392 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNM3	Q9UQ16	869 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PTGDR	Q13258	359 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLIC4	Q9Y696	253 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		15.99	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PFKFB1	P16118	471 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCL15	Q16663	113 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXO11	Q86XK2	927 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	MYCT1	Q8N699	235 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	GAS7	O60861	476 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	15.98	■□□□□ 0.15	2e-7	■■■■□ 23.8
NEDD4L-238	ENST00000635997	POSTN	Q15063	836 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	COBL	O75128	1261 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		15.98	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZMYM6	O95789	1325 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	DPF3	Q92784	378 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SNAP25	P60880	206 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	KIF5A	Q12840	1032 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
NEDD4L-238	ENST00000635997	FNBP1	Q96RU3	617 aa		15.97	■□□□□ 0.15

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