RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628757.2

PCBP1-AS1-333, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 623 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CDK8	P49336	464 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ARVCF	O00192	962 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CABYR	O75952	493 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ASGR1	P07306	291 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MS4A1	P11836	297 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	EPHB4	P54760	987 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TMEM240	Q5SV17	173 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	USP17L21	D6R901	530 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FDX1	P10109	184 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CSF2RA	P15509	400 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZNF365	Q70YC5	407 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PBX4	Q9BYU1	374 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MBD4	O95243	580 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CYP2D6	P10635	497 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CDK7	P50613	346 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GJA9	P57773	515 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NCOR1	O75376	2440 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ASB14	A6NK59	587 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ACR	P10323	421 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757		F5H6K3	240 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ADD2	P35612	726 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TNFAIP2	Q03169	654 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KLRC3	Q07444	240 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.78	□□□□□ -0.52

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