RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ATP8B3	O60423	1300 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	XKR9	Q5GH70	373 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FAM160B2	Q86V87	743 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM7	Q9C029	511 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	IFNK	Q9P0W0	207 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	HSPA4	P34932	840 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	RASA3	Q14644	834 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	KRT40	Q6A162	431 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	GTF3C6	Q969F1	213 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ADCY9	O60503	1353 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	GPBP1	Q86WP2	473 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	OR52Z1	P0C646	297 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	HOXD10	P28358	340 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	NLRP10	Q86W26	655 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	TNKS	O95271	1327 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PFDN6	O15212	129 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	MXRA7	P84157	204 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ITIH3	Q06033	890 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CROCCP2	Q86T23	111 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649		K7ENM7	598 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	RPS6KA4	O75676	772 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	OAT	P04181	439 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	MMP10	P09238	476 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CD19	P15391	556 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PTPRE	P23469	700 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FANCB	Q8NB91	859 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF202	O95125	648 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CUEDC2	Q9H467	287 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	DNAI1	Q9UI46	699 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	COL15A1	P39059	1388 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CUL4B	Q13620	913 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	POLA2	Q14181	598 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	AOC3	Q16853	763 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF365	Q70YC5	407 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	METTL23	Q86XA0	190 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	NELFB	Q8WX92	580 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	CAPN9	O14815	690 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SKAP1	Q86WV1	359 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	HESX1	Q9UBX0	185 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	DIP2A	Q14689	1571 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	GNAT1	P11488	350 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	COPB2	P35606	906 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	TRAPPC10	P48553	1259 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	NLRP12	P59046	1061 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	GEN1	Q17RS7	908 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	RNF169	Q8NCN4	708 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	AK8	Q96MA6	479 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ACACA-240	ENST00000617649	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24

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