RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 VEZTQ9HBM0 779 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 GPR108Q9NPR9 543 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 C2orf54Q08AI8 447 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 MYOCDQ8IZQ8 938 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 CLTCL1P53675 1640 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 KIF1BO60333 1816 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 LRRC7Q96NW7 1537 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRT-210ENST00000617474 OR52Z1P0C646 297 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SLC1A4P43007 532 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 LRRC41Q15345 812 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC63Q8NA47 563 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 KRIT1O00522 736 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 FOXN1O15353 648 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 DDIT3P35638 169 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 VPS41P49754 854 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 TCP10Q12799 353 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 EYA3Q99504 573 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ERVV-2B6SEH9 535 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 EXOC3O60645 756 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 RPS8P62241 208 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CHRNDQ07001 517 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 BIRC3Q13489 604 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MYCT1Q8N699 235 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 DNM3Q9UQ16 869 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ATP8B1O43520 1251 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SLC7A5Q01650 507 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 LLGL1Q15334 1064 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 KRT12Q99456 494 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ARMCX5Q6P1M9 558 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MAP3K9P80192 1104 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 STOX1Q6ZVD7 989 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC169A6NNP5 214 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 A6NNZ2 444 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 E2F4Q16254 413 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 TUBB8Q3ZCM7 444 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 VSIG1Q86XK7 387 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 WDR66Q8TBY9 1149 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 DPF2Q92785 391 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 C8orf37Q96NL8 207 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 TSKSQ9UJT2 592 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 GDAQ9Y2T3 454 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 PREX2Q70Z35 1606 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 PNPLA6Q8IY17 1366 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 A0A1B0GUA9 196 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SRGAP2O75044 1071 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF365Q70YC5 407 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 GPBP1Q86WP2 473 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SYNE4Q8N205 404 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CIAO1O76071 339 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 NDUFA10O95299 355 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MAP2K2P36507 400 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 NEK8Q86SG6 692 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CNBD1Q8NA66 436 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 EXOC4Q96A65 974 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MED14O60244 1454 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 TEX33O43247 280 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 KRT31Q15323 416 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 PAGE5Q96GU1 130 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ZBTB22O15209 634 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 IFT88Q13099 833 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 MTF1Q14872 753 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 TBC1D10CQ8IV04 446 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SWAP70Q9UH65 585 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 USTQ9Y2C2 406 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 STK38LQ9Y2H1 464 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC160A6NGH7 325 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRT-210ENST00000617474 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms