RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 KRT83P78385 493 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 DPYDQ12882 1025 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 NLRP3Q96P20 1036 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 CXCR5P32302 372 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 PARP10Q53GL7 1025 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 HPS3Q969F9 1004 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 MED15Q96RN5 788 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 FUT8Q9BYC5 575 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 TECP42680 631 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 SIK1P57059 783 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.47■□□□□ 0.07
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HPS1-215ENST00000613394 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.47■□□□□ 0.07
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HPS1-215ENST00000613394 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
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HPS1-215ENST00000613394 PPP2R5BQ15173 497 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-215ENST00000613394 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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HPS1-215ENST00000613394 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
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HPS1-215ENST00000613394 IQCEQ6IPM2 695 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 RRAGAQ7L523 313 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 H0YHG0 523 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-215ENST00000613394 BUB1O43683 1085 aa15.43■□□□□ 0.06
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